Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASSF3Q86WH2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASSF3Q86WH2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF3Q86WH2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASSF3Q86WH2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASSF3Q86WH2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASSF3Q86WH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms