Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC01551Q86U37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01551Q86U37 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01551Q86U37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01551Q86U37 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01551Q86U37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC01551Q86U37 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01551Q86U37 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01551Q86U37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01551Q86U37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms