Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMCO2Q7Z6W1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMCO2Q7Z6W1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMCO2Q7Z6W1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO2Q7Z6W1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO2Q7Z6W1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMCO2Q7Z6W1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMCO2Q7Z6W1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms