Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF550Q7Z398 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF550Q7Z398 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF550Q7Z398 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF550Q7Z398 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF550Q7Z398 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms