Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC11Q7Z392 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC11Q7Z392 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC11Q7Z392 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC11Q7Z392 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC11Q7Z392 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC11Q7Z392 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC11Q7Z392 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRAPPC11Q7Z392 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC11Q7Z392 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC11Q7Z392 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms