Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms