Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL4Q6ZR62 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL4Q6ZR62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL4Q6ZR62 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL4Q6ZR62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL4Q6ZR62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms