Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM44Q6ZP01 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM44Q6ZP01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM44Q6ZP01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBM44Q6ZP01 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM44Q6ZP01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM44Q6ZP01 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM44Q6ZP01 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM44Q6ZP01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms