Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms