Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 512.52□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 81.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF15-202ENST00000603346 702 ntTSL 23.3□□□□□ -1.888e-11■■■■■ 81.5
PRPF8Q6P2Q9 GCFC2-208ENST00000472230 2265 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 81.3
PRPF8Q6P2Q9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 81.3
PRPF8Q6P2Q9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 81.3
PRPF8Q6P2Q9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 81.3
PRPF8Q6P2Q9 GCFC2-205ENST00000470197 3648 ntTSL 1 (best)3.42□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 81.3
PRPF8Q6P2Q9 GCFC2-203ENST00000427862 632 ntTSL 3-0.23□□□□□ -2.452e-6■■■■■ 81.3
PRPF8Q6P2Q9 RBBP7-211ENST00000486166 1535 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 81.1
PRPF8Q6P2Q9 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 81.1
PRPF8Q6P2Q9 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.837e-9■■■■■ 81.1
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-201ENST00000261482 683 ntTSL 520.5■□□□□ 0.877e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.357e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-203ENST00000474542 650 ntTSL 414.97□□□□□ -0.017e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.497e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.497e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-204ENST00000497856 1779 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.687e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 REEP5-206ENST00000511865 1187 ntTSL 210.08□□□□□ -0.87e-22■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 XPO1-217ENST00000475744 249 ntTSL 2-1.35□□□□□ -2.631e-10■■■■■ 80.9
PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-208ENST00000536439 1426 ntTSL 315.57■□□□□ 0.082e-26■■■■■ 80.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPC-215ENST00000555127 929 ntTSL 25.43□□□□□ -1.543e-37■■■■■ 80.4
PRPF8Q6P2Q9 PRKDC-207ENST00000536483 834 ntTSL 210.81□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 80.3
PRPF8Q6P2Q9 PREP-202ENST00000448705 961 ntTSL 24.13□□□□□ -1.752e-42■■■■■ 80.3
PRPF8Q6P2Q9 NDUFV2-206ENST00000483511 335 ntTSL 57.22□□□□□ -1.254e-14■■■■■ 80.3
PRPF8Q6P2Q9 NDUFV2-204ENST00000474350 632 ntTSL 36.35□□□□□ -1.394e-14■■■■■ 80.3
PRPF8Q6P2Q9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 80.1
PRPF8Q6P2Q9 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 80.1
PRPF8Q6P2Q9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 80.1
PRPF8Q6P2Q9 FBXL6-204ENST00000524909 490 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-30■■■■■ 80.1
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.074e-20■■■■■ 79.9
PRPF8Q6P2Q9 KYAT3-204ENST00000446900 1937 ntTSL 51.25□□□□□ -2.212e-6■■■■■ 79.8
PRPF8Q6P2Q9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-17■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-17■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.625e-17■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 METTL9-207ENST00000567404 763 ntTSL 33.33□□□□□ -1.885e-17■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 METTL9-208ENST00000568826 376 ntTSL 32.83□□□□□ -1.965e-17■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.525e-17■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-214ENST00000451513 972 ntTSL 314.83□□□□□ -0.032e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-215ENST00000451830 549 ntTSL 411.55□□□□□ -0.562e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 GSTCD-204ENST00000484843 2228 ntTSL 211.27□□□□□ -0.612e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 NFKB1-211ENST00000513803 612 ntTSL 410.04□□□□□ -0.82e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-219ENST00000464282 558 ntTSL 49.77□□□□□ -0.852e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-207ENST00000424071 758 ntTSL 38.77□□□□□ -12e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 TTC37-210ENST00000512026 785 ntTSL 26.74□□□□□ -1.332e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-204ENST00000418682 584 ntTSL 55.81□□□□□ -1.482e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 NFKB1-203ENST00000502367 456 ntTSL 44.53□□□□□ -1.682e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 NFKB1-208ENST00000509165 557 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 GSTCD-205ENST00000503409 653 ntTSL 22.86□□□□□ -1.952e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ATG7-224ENST00000488924 570 ntTSL 41.79□□□□□ -2.122e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 ZRANB1-202ENST00000471421 587 ntTSL 21.73□□□□□ -2.132e-21■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 RFC4-213ENST00000489028 533 ntTSL 3-0.04□□□□□ -2.422e-11■■■■■ 79.7
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-209ENST00000507076 767 ntTSL 320.29■□□□□ 0.844e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-228ENST00000576582 575 ntTSL 59.55□□□□□ -0.884e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-206ENST00000503463 750 ntTSL 29.37□□□□□ -0.914e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-214ENST00000509415 558 ntTSL 49.37□□□□□ -0.914e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-202ENST00000372317 462 ntTSL 39.35□□□□□ -0.914e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-225ENST00000570513 553 ntTSL 49.35□□□□□ -0.914e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-227ENST00000575560 540 ntTSL 58.87□□□□□ -0.994e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-219ENST00000511697 558 ntTSL 48.72□□□□□ -1.014e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-217ENST00000510356 1009 ntTSL 1 (best)7.47□□□□□ -1.214e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-205ENST00000502761 724 ntTSL 26.37□□□□□ -1.394e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CALCOCO2-207ENST00000505071 495 ntTSL 54.11□□□□□ -1.754e-25■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-208ENST00000553516 669 ntTSL 28.55□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-215ENST00000557114 756 ntTSL 56.74□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-213ENST00000556563 646 ntTSL 35.81□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-207ENST00000553291 392 ntTSL 31.82□□□□□ -2.122e-9■■■■■ 79.5
PRPF8Q6P2Q9 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.565e-23■■■■■ 79.4
PRPF8Q6P2Q9 XRCC5-210ENST00000493706 564 ntTSL 22.19□□□□□ -2.061e-41■■■■■ 79
PRPF8Q6P2Q9 MAP4K3-209ENST00000475457 428 ntTSL 3-0.22□□□□□ -2.454e-8■■■■■ 79
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.343e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.23□□□□□ -1.733e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 23.52□□□□□ -1.853e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.853e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.953e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.973e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.993e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 32.3□□□□□ -2.043e-19■■■■■ 78.9
PRPF8Q6P2Q9 PMPCB-207ENST00000469560 1615 ntTSL 25.67□□□□□ -1.53e-14■■■■■ 78.8
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 57.8□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 78.7
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-225ENST00000488236 1320 ntTSL 55.84□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 78.7
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-220ENST00000476740 584 ntTSL 35.34□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 78.7
PRPF8Q6P2Q9 SETD5-222ENST00000478961 672 ntTSL 20.26□□□□□ -2.372e-7■■■■■ 78.7
PRPF8Q6P2Q9 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.292e-10■■■■■ 78.7
PRPF8Q6P2Q9 HACD1-206ENST00000632169 1434 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.533e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 HACD1-203ENST00000466335 717 ntTSL 218.07■□□□□ 0.483e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.223e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 AASDH-206ENST00000510762 538 ntTSL 37.17□□□□□ -1.263e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 CCT6A-204ENST00000466479 745 ntTSL 26.35□□□□□ -1.393e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 CLHC1-207ENST00000428621 2052 ntTSL 26.05□□□□□ -1.443e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.453e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 CCT6A-209ENST00000494736 411 ntTSL 25.47□□□□□ -1.533e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 AASDH-208ENST00000514745 2959 ntTSL 24.91□□□□□ -1.623e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 AASDH-204ENST00000503808 2949 ntTSL 24.69□□□□□ -1.663e-21■■■■■ 78.4
PRPF8Q6P2Q9 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.733e-21■■■■■ 78.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 4107.9 ms