Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL54Q6P161 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL54Q6P161 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL54Q6P161 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL54Q6P161 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL54Q6P161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL54Q6P161 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms