Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTN3Q6NUS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN3Q6NUS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTN3Q6NUS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCTN3Q6NUS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCTN3Q6NUS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCTN3Q6NUS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCTN3Q6NUS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms