Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms