Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC70Q6NSX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC70Q6NSX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC70Q6NSX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC70Q6NSX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC70Q6NSX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC70Q6NSX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms