Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHLDB3Q6NSJ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHLDB3Q6NSJ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHLDB3Q6NSJ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHLDB3Q6NSJ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHLDB3Q6NSJ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHLDB3Q6NSJ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHLDB3Q6NSJ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms