Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM225Q6GV28 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM225Q6GV28 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM225Q6GV28 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM225Q6GV28 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM225Q6GV28 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM225Q6GV28 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM225Q6GV28 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM225Q6GV28 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM225Q6GV28 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms