Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP350Q5VT06 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CEP350Q5VT06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP350Q5VT06 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP350Q5VT06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CEP350Q5VT06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CEP350Q5VT06 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CEP350Q5VT06 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CEP350Q5VT06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CEP350Q5VT06 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CEP350Q5VT06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP350Q5VT06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP350Q5VT06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP350Q5VT06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms