Protein–RNA interactions for Protein: Q5UCC4

EMC10, ER membrane protein complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC10Q5UCC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EMC10Q5UCC4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EMC10Q5UCC4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EMC10Q5UCC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EMC10Q5UCC4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EMC10Q5UCC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EMC10Q5UCC4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMC10Q5UCC4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms