Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP40Q5TG30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP40Q5TG30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGAP40Q5TG30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGAP40Q5TG30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP40Q5TG30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP40Q5TG30 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms