Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COLEC12Q5KU26 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COLEC12Q5KU26 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLEC12Q5KU26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COLEC12Q5KU26 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COLEC12Q5KU26 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COLEC12Q5KU26 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COLEC12Q5KU26 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms