Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRV8

TMEM255A, Transmembrane protein 255A, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM255AQ5JRV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM255AQ5JRV8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM255AQ5JRV8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM255AQ5JRV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM255AQ5JRV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM255AQ5JRV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM255AQ5JRV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM255AQ5JRV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM255AQ5JRV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM255AQ5JRV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM255AQ5JRV8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM255AQ5JRV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM255AQ5JRV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM255AQ5JRV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM255AQ5JRV8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM255AQ5JRV8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms