Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BSXQ3C1V8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BSXQ3C1V8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BSXQ3C1V8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BSXQ3C1V8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BSXQ3C1V8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BSXQ3C1V8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms