Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM21Q3B7S5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM21Q3B7S5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM21Q3B7S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM21Q3B7S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM21Q3B7S5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM21Q3B7S5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM21Q3B7S5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms