Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA4

CR1L, Complement component receptor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1LQ2VPA4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CR1LQ2VPA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CR1LQ2VPA4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1LQ2VPA4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CR1LQ2VPA4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CR1LQ2VPA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms