Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODF4Q2M2E3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ODF4Q2M2E3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODF4Q2M2E3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODF4Q2M2E3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF4Q2M2E3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms