Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CSPP1Q1MSJ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSPP1Q1MSJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CSPP1Q1MSJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CSPP1Q1MSJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSPP1Q1MSJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms