Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN21Q16825 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN21Q16825 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN21Q16825 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN21Q16825 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN21Q16825 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN21Q16825 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN21Q16825 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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