Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGCBQ16585 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCBQ16585 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCBQ16585 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCBQ16585 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCBQ16585 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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