Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF1Q15637 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF1Q15637 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF1Q15637 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF1Q15637 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF1Q15637 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SF1Q15637 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF1Q15637 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF1Q15637 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF1Q15637 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF1Q15637 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF1Q15637 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF1Q15637 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF1Q15637 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF1Q15637 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF1Q15637 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SF1Q15637 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SF1Q15637 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF1Q15637 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF1Q15637 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF1Q15637 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF1Q15637 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF1Q15637 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SF1Q15637 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF1Q15637 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF1Q15637 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF1Q15637 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF1Q15637 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF1Q15637 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF1Q15637 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SF1Q15637 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF1Q15637 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF1Q15637 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF1Q15637 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF1Q15637 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF1Q15637 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF1Q15637 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF1Q15637 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SF1Q15637 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF1Q15637 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF1Q15637 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SF1Q15637 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF1Q15637 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF1Q15637 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF1Q15637 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF1Q15637 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF1Q15637 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF1Q15637 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF1Q15637 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF1Q15637 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF1Q15637 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF1Q15637 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF1Q15637 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF1Q15637 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF1Q15637 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF1Q15637 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SF1Q15637 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF1Q15637 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF1Q15637 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF1Q15637 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF1Q15637 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF1Q15637 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF1Q15637 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF1Q15637 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF1Q15637 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF1Q15637 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF1Q15637 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF1Q15637 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF1Q15637 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF1Q15637 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF1Q15637 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF1Q15637 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF1Q15637 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF1Q15637 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF1Q15637 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF1Q15637 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF1Q15637 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF1Q15637 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF1Q15637 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF1Q15637 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF1Q15637 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF1Q15637 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SF1Q15637 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF1Q15637 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF1Q15637 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF1Q15637 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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