Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 520.23■□□□□ 0.838e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.568e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.368e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 217.04■□□□□ 0.328e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.188e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 215.24■□□□□ 0.038e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.138e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 214.06□□□□□ -0.168e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.288e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.48e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.048e-6■■■□□ 17.7
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SAFBQ15424 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.388e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 AC097512.1-202ENST00000503017 547 ntTSL 25.6□□□□□ -1.518e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 54.82□□□□□ -1.648e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-204ENST00000510121 486 ntTSL 33.67□□□□□ -1.828e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.988e-6■■■□□ 17.7
SAFBQ15424 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.368e-7■■■□□ 17.5
SAFBQ15424 APOL2-206ENST00000476579 583 ntTSL 415.76■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 17.3
SAFBQ15424 APOL2-209ENST00000529194 611 ntTSL 311.08□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 17.3
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 315.94■□□□□ 0.149e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.149e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.459e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.479e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 311.81□□□□□ -0.529e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 36.59□□□□□ -1.359e-7■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.654e-6■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)23.86■■□□□ 1.414e-6■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.094e-6■■■□□ 17.2
SAFBQ15424 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■■■□□ 16.9
SAFBQ15424 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.624e-6■■■□□ 16.9
SAFBQ15424 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.247e-7■■■□□ 16.8
SAFBQ15424 FAM13A-203ENST00000502459 1993 ntTSL 220.23■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 16.8
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SAFBQ15424 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 16.8
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SAFBQ15424 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■□□ 16.8
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SAFBQ15424 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 16.7
SAFBQ15424 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 16.4
SAFBQ15424 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-9■■■□□ 16.4
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SAFBQ15424 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.495e-8■■■□□ 16.1
SAFBQ15424 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.055e-8■■■□□ 16.1
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SAFBQ15424 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 16.1
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SAFBQ15424 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 54.28□□□□□ -1.721e-7■■■□□ 16
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SAFBQ15424 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.197e-7■■■□□ 15.9
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SAFBQ15424 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 211.49□□□□□ -0.577e-7■■■□□ 15.9
SAFBQ15424 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.482e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.9■■□□□ 1.262e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 ESYT2-204ENST00000483958 546 ntTSL 48.72□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-8■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-8■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 15.8
SAFBQ15424 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 15.7
SAFBQ15424 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 57.87□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15.7
SAFBQ15424 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15.7
SAFBQ15424 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.91e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.791e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.641e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.51e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.291e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.061e-8■■■□□ 15.6
SAFBQ15424 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.041e-8■■■□□ 15.6
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