Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRRQ15256 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRRQ15256 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRRQ15256 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRRQ15256 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRRQ15256 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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