Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERPUD1Q15011 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERPUD1Q15011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD1Q15011 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERPUD1Q15011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD1Q15011 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD1Q15011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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