Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GPNMBQ14956 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPNMBQ14956 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPNMBQ14956 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPNMBQ14956 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GPNMBQ14956 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPNMBQ14956 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPNMBQ14956 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
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