Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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