Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM39Q14498 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM39Q14498 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM39Q14498 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM39Q14498 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM39Q14498 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM39Q14498 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM39Q14498 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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