Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE1CQ14123 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE1CQ14123 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1CQ14123 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE1CQ14123 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE1CQ14123 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE1CQ14123 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
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