Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A6Q14031 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A6Q14031 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A6Q14031 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A6Q14031 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A6Q14031 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A6Q14031 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms