Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK2Q13002 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK2Q13002 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK2Q13002 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIK2Q13002 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIK2Q13002 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK2Q13002 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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