Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXI1Q12951 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXI1Q12951 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXI1Q12951 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXI1Q12951 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXI1Q12951 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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