Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF90Q03938 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF90Q03938 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF90Q03938 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF90Q03938 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms