Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARDQ03181 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARDQ03181 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPARDQ03181 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARDQ03181 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPARDQ03181 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARDQ03181 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPARDQ03181 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPARDQ03181 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARDQ03181 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARDQ03181 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPARDQ03181 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPARDQ03181 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPARDQ03181 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARDQ03181 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARDQ03181 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARDQ03181 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARDQ03181 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPARDQ03181 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms