Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCNT1Q02742 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCNT1Q02742 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCNT1Q02742 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCNT1Q02742 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCNT1Q02742 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNT1Q02742 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNT1Q02742 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCNT1Q02742 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNT1Q02742 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT1Q02742 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCNT1Q02742 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms