Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL13RA1P78552 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL13RA1P78552 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL13RA1P78552 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL13RA1P78552 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL13RA1P78552 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL13RA1P78552 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL13RA1P78552 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms