Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS3AP61247 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS3AP61247 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS3AP61247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS3AP61247 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS3AP61247 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS3AP61247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms