Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMFBP60983 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMFBP60983 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMFBP60983 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMFBP60983 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMFBP60983 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMFBP60983 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMFBP60983 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMFBP60983 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMFBP60983 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GMFBP60983 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMFBP60983 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMFBP60983 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMFBP60983 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMFBP60983 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMFBP60983 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GMFBP60983 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMFBP60983 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMFBP60983 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMFBP60983 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMFBP60983 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMFBP60983 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMFBP60983 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMFBP60983 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMFBP60983 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMFBP60983 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMFBP60983 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GMFBP60983 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMFBP60983 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMFBP60983 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMFBP60983 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMFBP60983 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMFBP60983 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GMFBP60983 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMFBP60983 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMFBP60983 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMFBP60983 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMFBP60983 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMFBP60983 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMFBP60983 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMFBP60983 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMFBP60983 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMFBP60983 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMFBP60983 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMFBP60983 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMFBP60983 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMFBP60983 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMFBP60983 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMFBP60983 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMFBP60983 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMFBP60983 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMFBP60983 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMFBP60983 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GMFBP60983 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMFBP60983 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMFBP60983 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMFBP60983 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMFBP60983 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMFBP60983 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMFBP60983 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMFBP60983 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMFBP60983 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GMFBP60983 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMFBP60983 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMFBP60983 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMFBP60983 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMFBP60983 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMFBP60983 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMFBP60983 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMFBP60983 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMFBP60983 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMFBP60983 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMFBP60983 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMFBP60983 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMFBP60983 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMFBP60983 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMFBP60983 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMFBP60983 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMFBP60983 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMFBP60983 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMFBP60983 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMFBP60983 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMFBP60983 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMFBP60983 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMFBP60983 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMFBP60983 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMFBP60983 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms