Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFRD-1P60508 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVFRD-1P60508 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFRD-1P60508 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms