Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WNT3AP56704 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WNT3AP56704 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WNT3AP56704 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WNT3AP56704 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
WNT3AP56704 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WNT3AP56704 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
WNT3AP56704 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WNT3AP56704 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WNT3AP56704 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms