Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA1P56199 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA1P56199 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA1P56199 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA1P56199 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA1P56199 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA1P56199 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms