Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRX1P54821 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRX1P54821 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRX1P54821 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRX1P54821 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRX1P54821 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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