Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN3P54252 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN3P54252 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN3P54252 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN3P54252 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATXN3P54252 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN3P54252 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms