Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMK2P53671 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMK2P53671 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LIMK2P53671 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LIMK2P53671 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LIMK2P53671 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK2P53671 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIMK2P53671 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms