Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCN2P51788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCN2P51788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN2P51788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN2P51788 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN2P51788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN2P51788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN2P51788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN2P51788 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms