Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP2P46087 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP2P46087 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP2P46087 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP2P46087 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP2P46087 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP2P46087 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP2P46087 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP2P46087 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP2P46087 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP2P46087 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP2P46087 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP2P46087 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP2P46087 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP2P46087 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP2P46087 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOP2P46087 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP2P46087 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP2P46087 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP2P46087 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP2P46087 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP2P46087 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP2P46087 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP2P46087 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP2P46087 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP2P46087 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP2P46087 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP2P46087 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP2P46087 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP2P46087 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP2P46087 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP2P46087 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP2P46087 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NOP2P46087 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP2P46087 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP2P46087 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP2P46087 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP2P46087 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP2P46087 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP2P46087 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP2P46087 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP2P46087 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP2P46087 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP2P46087 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP2P46087 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP2P46087 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP2P46087 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NOP2P46087 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NOP2P46087 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOP2P46087 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NOP2P46087 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP2P46087 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOP2P46087 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOP2P46087 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP2P46087 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOP2P46087 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOP2P46087 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOP2P46087 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOP2P46087 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP2P46087 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP2P46087 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP2P46087 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOP2P46087 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP2P46087 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP2P46087 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP2P46087 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP2P46087 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP2P46087 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP2P46087 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP2P46087 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP2P46087 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP2P46087 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP2P46087 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP2P46087 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP2P46087 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP2P46087 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP2P46087 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP2P46087 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP2P46087 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP2P46087 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP2P46087 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP2P46087 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP2P46087 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP2P46087 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP2P46087 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP2P46087 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP2P46087 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP2P46087 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP2P46087 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP2P46087 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP2P46087 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP2P46087 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP2P46087 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP2P46087 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP2P46087 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP2P46087 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP2P46087 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP2P46087 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP2P46087 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP2P46087 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms